原發(fā)類和復發(fā)類生殖器皰疹的顯微鏡像表現(xiàn)極其相似，并且都與帶狀皰疹和水痘的顯微鏡像類似。生殖道皰疹顯微鏡下最為突出的表現(xiàn)是上皮細胞內囊泡形成。造成這種現(xiàn)象的原因是上皮細胞的退變，尤其是棘皮層的松解及角質層下方的液體積累。表皮與真皮層的自細胞大量浸潤會在病毒感染后很快出現(xiàn)。如果上皮的退變波及到最深的上皮細胞，在囊泡破裂之后就可以形成真正的淺表潰瘍。退變上皮細胞的氣球樣變是病毒感染的特征性變化。處在退變中的上皮細胞常會體積擴大成為多核細胞，進而演變?yōu)椴《拘途藜毎�。這些巨細胞最常見于皰疹病變的邊緣部位。細胞內可出現(xiàn)核內包涵體。包涵體通常為嗜酸性，呈卵圓形，位于細胞核內，周圍被覆暈光。有包涵體出現(xiàn)時，細胞核的染色質通常會被擠聚到靠近核膜的邊緣區(qū)域。

皰疹感染特征性的細胞學變化已經有Ng等(1970年)做過詳細的描述。細胞核的變化主要是通常與不規(guī)則排列的細小的嗜堿性核內顆粒有關聯(lián)的微小核內空泡。有些細胞核可呈現(xiàn)為均勻一致的“毛玻璃”樣。細胞核內出現(xiàn)稀疏的、通常伴有周邊亮區(qū)的嗜酸性核內包涵體是皰疹感染的細胞學變化的另一個特征。