原發(fā)性生殖器皰疹潛伏期為2～10天，即在2～10天前有不潔性交。由于在性交中，局部粘膜有很小的損傷，生殖器皰疹病毒進入局部粘膜，引起感染。
患病部位先有燒灼感，很快在紅斑基礎(chǔ)上發(fā)展，原發(fā)損害為1個或多個小而瘙癢的紅丘疹，伴有瘙癢，迅速變成小水皰，3～5天后可形成膿皰，破潰后形成糜爛、潰瘍、結(jié)痂，伴有疼痛，最后結(jié)痂愈合。皮損單發(fā)或融合。由于人體對它還沒有任何免疫力，初次發(fā)生皰疹一般較大，疼痛也明顯。整個病程可持續(xù)20天左右。
