消滅傳染源是預防措施之一，除治愈患者外，必須對托幼、飲食業(yè)及自來水廠工作人員定期檢查，及時發(fā)現(xiàn)帶菌者，調離工作崗位并予以治療。切實做好飲食衛(wèi)生、水源及糞便管理,消滅蒼蠅,切斷傳播途徑，防止病從口入。增強機體免疫力，中國正在試用口服菌痢活疫苗，以刺激腸道持續(xù)產生分泌型IgA,保護人體免受痢疾桿菌的侵襲。

細菌性痢疾的預防和其他消化道傳染病的預防一樣。

首先，要管理好傳染源，早期發(fā)現(xiàn)患者和帶菌者，早期隔離，要積極徹底地進行治療。

第二，切斷傳播途徑，喝開水不喝生水，用消毒過的水洗瓜果蔬菜和碗筷及漱口。注意個人衛(wèi)生，養(yǎng)成飯前便后洗手的良好衛(wèi)生習慣。

第三，切斷傳播途徑，認真貫徹執(zhí)行“三管一滅”（即管好水源、食物和糞便、消滅蒼蠅）。

第四，保護易感人群，近年來使用志賀菌依鏈株減毒活菌苗口服，可產生IgA，以防止痢菌菌毛貼附于腸上皮細胞，從而防止其侵襲和腸毒素的致瀉作用。

也有學者采用X線照射及氯霉素或亞硝胍誘變等不同方式獲得減毒變異株，用于主動免疫，已獲初步效果。但總的來說，由于痢疾桿菌的亞型比較多，因此，制成特異性的疫苗難度較大。另外，病愈后機體產生的特異性免疫持續(xù)時間也不長，因此，最重要的預防措施還是切斷傳播途徑。